注册公司和办理营业执照，两者在含义、目的、流程、花费以及结果上存在显著差异。首先，注册公司是指根据《公司法》规定，经过相关部门核准登记成立的新公司。而办理营业执照则是所有市场主体，包括公司、个体工商户、农村合作社等，申请获取合法营业资格的过程。
其次，注册公司的目的是设立一个商业实体，合法进行资金往来，独立承担民事责任，并受到法律保护，有利于提高社会信任度和盈利能力。办理营业执照则是为了给予各类经营主体进入市场的“凭证”。在我国，未经营业执照的公司企业或个体经营者，一律不得开业。
在流程上，注册公司需要经历核名、办理营业执照、刻制公章、开设银行对公账户、税务登记等环节。而办理营业执照的流程相对简单，主要包括核名和提交办照材料两个步骤。一旦材料齐全且符合法定形式，即可获得营业执照。
在花费上，注册公司无论是自行办理还是委托代办，都需要一定的费用。例如，企业刻章、银行开户等环节，都需要支付一定的费用。但如果熟悉流程和材料，办理营业执照基本上不需要额外花费。目前，我国鼓励创新创业，营业执照正副本均无偿核发，甚至可以邮寄到家。
最后，注册公司和办理营业执照的结果不同。完成注册公司流程后，企业可以安心开展业务活动，只要遵纪守法，合法运营公司，基本不会遇到风险。而只有营业执照的公司，运营起来会相对麻烦。例如，签订合同、印发文件需要公章，发生资金收付需要银行对公账户。更重要的是，税务登记具有强制性，若未能及时完成税务登记，将会受到处罚。
在深圳，办理个体营业执照所需的材料包括：隶属企业董事会的决议或股东会决议、隶属企业营业执照、代码、国、地税的复印件各三份盖章、分公司负责人的任职文件及照片2张、隶属企业章程复印件盖章两份、隶属企业验资报复印件加盖公章2份、分公司注册地房产证复印件及房屋租赁协议两份、公司法定代表人签署的《分公司设立登记申请书》、分公司的经营范围不得超出总公司的经营范围、委托企业登记代理的委托书等。办证流程相对简单，只需按照相关规定提交材料，符合条件的即可获得营业执照。
